Internetadresse(r):

Overordnet internetadresse: www.rm.dk

Indkøb af 1 sekvenator (NGS)

Indkøb af 1 sekvenator (NGS).

Region Midt har til hensigt at indkøbe en sekvenator. Der kræves en sekvenator med en kapacitet til at sekventere 2 000-3 000 genomer/år med en dækning på 30 x og en meget lav fejlrate (>75 % af baser >Q30) hvilket er jf. gældende internationale standarder (se f.eks. cap.org/member=resources/precision-medicine/next-generation-sequencing-ngc-worksheets). Fejl-raten skal være meget lav for alle varianttyper (enkeltbase varianter, insertioner og deletioner), hvilket pt. kun understøttes af sequencing-by-synthesis og paired-end sequencing.

Sekvenatoren skal derudover være fleksibel og kunne analysere hele genomer, exomer, targeterede paneler og RNA sekventering. Der skal være en kapacitet på ≥ 5 000 000 000 reads/run.

Afslutningsvis er det et krav, at der er fuld interoperabilitet med afdelingens nuværende delvist automatiserede prøveflow herunder eksisterende sekvenator. Indkøbet har til hensigt at fungere som back up for den sidste del i prøveflowet, dvs. selve sekventeringen efter den primære prøvebehandling fra DNA til sekventeringsklart bibliotek. Disse behandlede biblioteker skal kunne overføres til back up apparatur uden, at det i øvrigt negativt påvirker kliniske svartider eller automatiseringsgraden. Dette er ikke muligt med andre fabrikater end Novaseq fra Illumina.

Ja, serviceoptioner.

Region Midt har til hensigt at indkøbe en sekvenator. Der kræves en sekvenator med en kapacitet til at sekventere 2 000-3 000 genomer/år med en dækning på 30 x og en meget lav fejlrate (>75 % af baser >Q30) hvilket er jf. gældende internationale standarder (se f.eks. cap.org/member=resources/precision-medicine/next-generation-sequencing-ngc-worksheets). Fejl-raten skal være meget lav for alle varianttyper (enkeltbase varianter, insertioner og deletioner), hvilket pt. kun understøttes af sequencing-by-synthesis og paired-end sequencing.

Sekvenatoren skal derudover være fleksibel og kunne analysere hele genomer, exomer, targeterede paneler og RNA sekventering. Der skal være en kapacitet på ≥ 5 000 000 000 reads/run.

Afslutningsvis er det et krav, at der er fuld interoperabilitet med afdelingens nuværende delvist automatiserede prøveflow herunder eksisterende sekvenator. Indkøbet har til hensigt at fungere som back up for den sidste del i prøveflowet, dvs. selve sekventeringen efter den primære prøvebehandling fra DNA til sekventeringsklart bibliotek. Disse behandlede biblioteker skal kunne overføres til back up apparatur uden, at det i øvrigt negativt påvirker kliniske svartider eller automatiseringsgraden. Dette er ikke muligt med andre fabrikater end Novaseq fra Illumina.

Præcise oplysninger om klagefrister

Klage skal være indgivet til Klagenævnet for Udbud indenfor 30 kalenderdage regnet fra dagen efter den dag, hvor ordregiveren har offentliggjort en bekendtgørelse i Den Europæiske Unions Tidende om, at ordregiveren har indgået en kontrakt. Samtidig med klagens fremsendelse til Klagenævnet for Udbud skal klageren sende en kopi af klagen med bilag til ordregiveren, gerne per e-mail.